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中國野蓮居群遺傳多樣性及群體結構分析

劉正位  肖彬  朱紅蓮  匡晶  季群  彭靜  李峰  孫亞林  柯衛東  
【摘要】:以我國長江中下游地區和北方地區33個居群的195份野蓮(Nelumbo nucifera Gaertn.)為材料,基于SLAF簡化基因組測序技術,對不同區域野蓮居群的遺傳多樣性進行研究。結果顯示:通過測序共得到742 992個SLAF標簽,挖掘高質量SNP位點1 064 789個;供試材料基因型差異明顯,主要可分為長江流域和東北區域2個亞群。研究結果支持長江流域野蓮和東北區域野蓮應分屬為亞熱帶及溫帶生態型蓮。我國野蓮居群總多樣性較低(π=1.04×10-5),居群間平均分化系數較高(FST=0. 42)。長江中下游地區不同湖泊野蓮π值變幅為0.5×10-5~2. 2×10-5,梁子湖野蓮多樣性最為豐富。梁子湖區域內各個小湖π值為3.13×10-6~2. 3×10-5,表明小湖內不同居群仍存有較大遺傳差異。北部地區不同湖泊野蓮π值變幅為3.05×10-6~1. 50×10-5,山東梁山古代蓮多樣性最為豐富。長江中下游地區野蓮遺傳多樣性高于北部地區且兩者間分化程度較高(FST=0. 34),表明野蓮居群間和區域間均有較高的分化程度,原因可能是野蓮居群內主要為克隆繁殖,而居群間基因交流少所致。
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